中国科学技术信息研究所每年出版的《中国科技期刊引证报告》（核心版）发布中国科技论文与引文数据库收录的中国科技论文核心期刊的二十余项科学计量指标，并从1999年开始以此基础，研制了中国科技期刊综合评价指标体系，采用层次分析法，由专家打分确定了重要指标的权重，并分学科对每种期刊进行综合评定。2002年公布了第一届中国百种杰出学术期刊名单，自此之后，连续每年公布中国百种杰出学术期刊。2011年根据指标体系实施应用以来我国学术期刊的变化趋势和实际状况，修订了期刊指标体系，对指标权重进行了重新核定。2013年根据中国科技核心期刊分类体系的细分调整，择优选择各学科类别中最重要的期刊作为杰出学术期刊。同时考虑到不同学科的性质和期刊规模，适当调整学科间分配的比例。最终评选出2012年百种杰出学术期刊100种，《昆虫学报》名列其中。 

　　根据2013年出版的《中国科技期刊引证报告》（核心版）有关数据，在总被引频次、影响因子和综合评价总分等期刊评价主要指标上《昆虫学报》均在昆虫学、动物学类期刊中排名第一，在全部1994种核心期刊中的综合评价总分排名为第36名。 

　　为了提高我国科技期刊总体水平，增强国际竞争力，同时也为了更好地对外宣传我国的优秀科研成果，形成开放和凝聚的力量，为我国科技自主创新提供支撑和保障，2012年中国科学技术信息研究所集中力量启动了“领跑者5000——中国精品科技期刊顶尖学术论文”项目（F5000项目）。项目通过定量分析遴选和同行评议推荐相结合的方式，选出了首批F5000候选论文，并建设运行了F5000项目工作平台系统（f5000.istic.ac.cn）。在中国精品科技期刊各个编辑机构的热情支持和密切协作下，候选论文的中英文摘要都扩充了内容。最终遴选出2500余篇著录内容完整、学术水平和影响较为突出的论文正式入选2012年度“领跑者5000——中国精品科技期刊顶尖学术论文”即2012年度F5000论文，《昆虫学报》2102年55卷第2期和第9期各有一篇论文入选。