3月3日下午,陕西师范大学副教授李广林应上海辰山植物园(澳门赌场上海辰山植物科学研究中心)副研究员严岳鸿的邀请来访辰山,并为辰山科研中心的科研人员做了题为《生物信息学在高通量测序数据中的应用》的报告。在近两个小时的报告中,李广林热情洋溢地为大家介绍了高通量二代测序的原理、应用,并结合自己在研的两个项目“禾本科植物萜类合成酶的功能与进化”和“黄萎病的致病机理”系统详实地讲解了生物信息学在生物学领域的具体应用。
以Roche/454和Illumina/Solexa为代表的二代高通量测序技术诞生于本世纪初,是生命科学中里程碑式的事件,对生物学宏观、微观各大研究领域都产生了深远影响。Roche/454测序技术是最早开发的二代高通量测序技术之一;早在其诞生之初,李广林就开始利用其进行衣藻中microRNA的研究。在接下来的工作中,他先后参与了蕨类植物江南卷柏、被子植物基部类群无油樟全基因组的测序组装工作。在对萜类合成酶的研究中,他发现这类基因家族在低等植物至高等植物的进化过程中发生了明显的倍增,进而利用高通量测序技术结和信息学的分析阐明了其倍增的机制,并找到了其序列中保守的重要功能调控位点。接下来他结合分子遗传学、代谢组学等研究手段使这些预测的功能位点得到了生物学验证。
本次报告由蕨类植物多样性与进化课题组组长严岳鸿主持,吸引了众多科研人员和在读研究生的参加。报告结束后,大家热烈提问,李广林均给予了热情详细的解答,共创了良好的交流合作氛围。