日本东京工业大学等机构参与的一个国际研究小组，22日在新一期美国期刊《基因组研究》上报告说，他们分别对生活在非洲东部坦桑尼亚近海和印度尼西亚近海的5条腔棘鱼进行了基因组测序，发现从进化角度来看，虽然生活在这两处海域的腔棘鱼在大约三千万年前分道扬镳，但它们的基因组序列只有0．18％不同，几乎难以认定是不同物种。

研究人员解释说，与人类和黑猩猩分道扬镳后基因组序列的变化速度相比，腔棘鱼基因组序列的变化速度约为前者的四十分之一，这也许是腔棘鱼被称为“活化石”的原因之一。

研究小组还在腔棘鱼基因组中发现了与形成陆地动物四肢和嗅觉功能有关的基因群。研究人员表示，这一发现对于研究生物进化、尤其是四足动物的进化具有重要意义。

东京工业大学名誉教授冈田典弘指出，生活在水中的腔棘鱼理应不需要形成四肢和嗅觉功能的基因群，因此这些基因可能有其他用途。比如形成四肢的基因可以让鱼鳍发育出强大的内部骨骼，从而使身体更稳固地附着在海底岩石上。